根據分析對象，色譜柱的類型，操作氣相色譜儀的檔次和具體檢測器，若使用不合要求的低純度氣體，不良影響有以下幾種可能：  

    1、樣品失真或消失：如H2O氣使氯硅樣品水解；  

    2、色譜柱失效：H2O，CO2使分子篩柱失去活性，H2O氣使聚脂類固定液分解，O2使PEG固定液斷鏈。  

    3、有時某些氣體雜質和固定液相互作用而產生假峰；  

    4、對柱保留特性的影響：如H2O對聚乙二醇等親水性固定液的保留指數會有所增加，載氣中氧含量過高時，無論是極性或是非極性固定液柱的保留特性，都會產生變化，使用時間越長影響越大；  

    5、檢測器：TCD：信噪比減小，無法調零，線性變窄，文獻中的校正因子不能使用，氧含量過大，使元件在高溫時加速老化，減少壽命；FID：特別是在Dt≤1×10-11/S下操作時，CH4等有機雜質會使基流激增，噪聲加大不能進行微量分析；  

    6、在做程序升溫操作時，載氣中的某些雜質，在低溫時保留在色譜柱中，當柱溫升高時不但引起流動相沖洗，柱與流動相達到平衡后，檢測器測出一段時間的流出曲線。一般應平行于時間軸。》基線漂移，還可能在譜圖上出現比較寬的“假峰"。